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研究队伍
姓 名:
 郑杰
性 别:
 男
职 称:
 研究员
学 历:
 博士
电 话:
 021-50800161
传 真:
 
电子邮件:
 jzheng@simm.ac.cn
个人主页:
通讯地址:
 上海市浦东张江祖冲之路555号 201203
简历:

  郑杰,课题组长,研究员。课题组主要研究方向是基于生物大分子氢氘交换质谱(蛋白质动力学)、交联质谱、组学技术的开发以及应用;并结合分子生物学、生物化学、生物物理学手段交叉解决由蛋白质(酶)的动力学异常变化所导致的重大疾病的发生机制,包括天然免疫病原相关模式识别受体的信号识别机制,由临床检测基因突变导致的自身免疫疾病发生机制等生物学热点问题,为抗感染药物和治疗性抗体的设计,以及自身免疫病、炎性疾病以及肿瘤的防治和治疗提供临床参考。近五年共发表和接收SCI研究论文16篇,其中6篇以第一作者发表于Nature Communications(2篇)、Nucleic Acids ResearchStructure、VirologyCurrent opinions of structure biology等杂志。文章引用次数230次,H指数7。

教育经历: 

  2010/08 – 2015/06 南洋理工大学 博士

  2006/08 – 2010/06 中国药科大学 学士

工作经历

  2019/1–至今 课题组长,研究员,中国科学院上海药物研究所

  2015/7 – 2019/1 博士后,分子医学院 , 美国斯克瑞普斯研究所


研究方向:

基于生物大分子氢氘交换质谱(蛋白质动力学)、交联质谱、组学技术的开发以及应用;并结合分子生物学、生物化学、生物物理学手段交叉解决由蛋白质(酶)的动力学异常变化所导致的重大疾病的发生机制,包括天然免疫病原相关模式识别受体的信号识别机制,由临床检测基因突变导致的自身免疫疾病发生机制等生物学热点问题,为抗感染药物和治疗性抗体的设计,以及自身免疫病、炎性疾病以及肿瘤的防治和治疗提供临床参考。目前,美国多家大型制药企业(包括辉瑞、礼来、默克、勃林格、百时美施贵宝、武田制药等)都已经搭建了氢氘交换质谱平台,证明了该技术在药物发现、抗原抗体表位定位筛选、单克隆抗体偶联药物研究等领域的巨大应用前景。


专家类别:
研究员

职务:
课题组长

科研成果:

全自动高通量氢氘交换质谱技术的研发与应用,生物大分子蛋白质动态构象变化,化学交联质谱,蛋白质组学 ,分子生物学,生物物理,药物发现交叉应用
1.阐述RIG-I受体基因突变导致的自身免疫疾病的机理 (第一作者兼共同通讯文章发表Nature Communications)
2.RNA病毒感染以及天然免疫RIG-I样受体的激活机理研究(第一作者发表 Nucleic Acids Research
3.运用氢氘交换质谱技术对近100个VDR选择性抑制剂进行了功能性筛选并首次报道了用于治疗骨质疏松的选择性激活剂的化学结构和作用机理。药物与药物靶点作用,核受体蛋白代谢疾病转录调控以及药物精准医疗 (第一作者发表Nature Communications)
4.首次报道了PPARγ的选择性抑制剂SR11023及其抑制机理,为治疗二型糖尿病提供了新的思路 (第一作者发表于Cell Press Structure
5.蛋白质组学,氢氘交换质谱技术,分子生物学,生物物理学 (三篇第一作者综述文章Frontiers in microbiologyAnalytica chimica acta和Current Opinion of Structure Biology)(交叉学科应用)方向:病原体生物质谱检测技术
6.蛋白质组学研究 病毒表面膜蛋白的 N-糖基化 与其功能 (第一作者发表 Virology杂志)大方向:病原体膜蛋白糖基化研究和病原体蛋白翻译后修饰检测


承担科研项目情况:

社会任职:

获奖及荣誉:

代表论著:

1.Zheng J, Strutzenberg ST, Bruce Pascal BD, and Griffin PR. Protein dynamics and conformational changes explored by Hydrogen/deuterium exchange Mass spectrometry (In press). Current Opinion of Structure Biology.
2.Zheng J*#, Wang C#, Chang MR, Devarkar SC, Schweibenz B, Crynen GC, Garcia-Ordonez RD, Pascal BD, Novick SJ, Patel SS, Marcotrigiano J*, Griffin PR*. HDX-MS reveals dysregulated checkpoints that compromise discrimination against self RNA during RIG-I mediated autoimmunity. Nature communications. 2018; 9(1):5366.
3.Zheng J#, Corzo C#, Chang MR, Shang J, Lam VQ, Brust R, Blayo AL, Bruning JB, Kamenecka TM, Kojetin DJ, Griffin PR. Chemical Crosslinking Mass Spectrometry Reveals the Conformational Landscape of the Activation Helix of PPARγ; a Model for Ligand-Dependent Antagonism. Structure. 2018; 26(11):1431-1439.e6.
4.Zheng J#, Yamada Y#, Fung TS#, Huang M, Chia R, Liu DX. Identification of N-linked glycosylation sites in the spike protein and their functional impact on the replication and infectivity of coronavirus infectious bronchitis virus in cell culture. Virology. 2018; 513:65-74.
5.Zheng J#, Chang MR, Stites RE, Wang Y, Bruning JB, Pascal BD, Novick SJ, Garcia-Ordonez RD, Stayrook KR, Chalmers MJ, Dodge JA, Griffin PR. HDX reveals the conformational dynamics of DNA sequence specific VDR co-activator interactions. Nature communications. 2017; 8(1): 923.
6.Zheng J#, Yong HY, Panutdaporn N, Liu C, Tang K, Luo D*. High-resolution HDX-MS reveals distinct mechanisms of RNA recognition and activation by RIG-I and MDA5. Nucleic acids research. 2015; 43(2):1216-30.
7.Zheng J#, Tan BH, Sugrue R, Tang K*. Current approaches on viral infection: proteomics and functional validations. Frontiers in microbiology. 2012; 3:393.
8.Zheng J#, Sugrue RJ, Tang K*. Mass spectrometry based proteomic studies on viruses and hosts--a review. Analytica chimica acta. 2011; 702(2):149-59.